בית הכנסת הגבוהה (Vysoká synagoga) בפראג הינו בית כנסת שעומד ברחוב צ'רבנה (Červená) במרכז הרובע היהודי יוזפוב שבעיר. עלויות בניית בית הכנסת נתרמו על ידי יהודי צ'כי עשיר בשם מורדכי מייזל אשר עליו קרוי מלבד לרחוב הראשי ברובע היהודי גם כן בית כנסת נוסף בפראג (בית כנסת מייזל). בית הכנסת הגבוהה בפראג נבנה לצד בניית בית הקהילה היהודית בשנת 1577. בית הכנסת היה משמש כבית תפילה עבור עובדי בית הקהילה היהודית שבעיר ולכן הכניסה אליו היא דרך הקומה הראשונה של בניין הקהילה. בית הכנסת הגבוה ממוקם מול בית הכנסת החדש-ישן בפראג (האלטנוישול) אליו משקיפים שלושה חלונות גדולים של בית הכנסת. מלבד לשלושת החלונות בצד הצפוני של בית הכנסת היו גם שני חלונות נוספים בצידו המזרחי. בית שני החלונות עומד ארון הקודש של בית הכנסת.
בית הכנסת הגבוהה בפראג פעמים ניצל משרפה שפגעה בו בשנת 1689 ושופץ בשנת 1754. במהלך המחצית השניה של המאה ה-20 השימוש בבית הכנסת הגבוהה חודש. בקומה הראשונה בבית הכנסת מתקיימים תפילות שחרית בעיקר במהלך השבוע ובקומת הקרקע של הבניין תמצאו היום קופה לקניית כרטיסים וחנות של המוזיאון היהודי בפראג